Egzistojnë shumë arsye se përse bëhet kjo procedurë:
1. Amniocenteza gjenetike siguron kontrollimin e materialit trashëgues (kromozomeve) dhe atë sipas rekomandimit të mjekut pas rezultateve të mëparshme të testeve të anomalive, pas informimit të mjekut për sëmundjet në familje dhe në fund janë të domosdoshme konsultimet me gjenetikun, por vendimi është në ju, nëse doni ta bëni amniocentezën.
Me këtë metodë vërtetohet nëse egziston rreziku nga paraqitja e Sindromit Daun, Tarner, Eduardson apo Patau, mund të vërtetohen edhe anomali të tjera të foshnjeve (humbja e shqisave të dëgjimit apo të pamurit). Gjithashtu, në këtë mënyrë mund të vërtetohet me siguri edhe gjinia e foshnjes.
2. Vërtetimi i pjekurisë së mushkërive – më saktësisht kontrollohet nëse mushkeritë e foshnjes janë të gatshme për lindje. Ky tip i amniocentezës bëhet në rastet e komplikimeve të caktuara kur shtatzëna duhet të lind më herët. Kjo procedurë bëhet nga java e 32-të, më se voni gjer në javën e 39-të.